了这颗陨石，总统当时还是项目负责人，他亲眼目睹了陨石晶体与实验动物的意识共振，却在上报时谎称“发现无害矿石”。而“意识清除武器”的研发，根本不是为了镇压叛乱，而是为了激活这颗晶体，与所谓的“主文明”建立联系。
就在这时，洞穴外传来一阵震天动地的轰鸣声。沈溯通过岩层的意识“看见”，城市的各个角落都出现了巨大的能量光柱，这些光柱从共生网络的节点升起，穿透蓝雾，直抵云霄。而在大气层外，无数艘造型奇特的飞船正穿过星云，朝着地球驶来。它们的外壳上，同样刻着与共生核心一致的金色图腾。
“是主文明的舰队？”队长握紧了拳头，动力装甲的武器系统自动激活。
沈溯却摇了摇头，他的意识已经与其中一艘飞船建立了微弱的连接。飞船的意识中没有敌意，只有一种深沉的疲惫和渴望，但同时，还有一段让他心惊的记忆碎片：“共生计划第三阶段，回收失控节点，清除变异意识体。”
“变异意识体？指的是我们吗？”一名投降的联邦士兵脸色惨白，他的意识中突然涌入大量飞船的记忆——无数颗星球被这种蓝色晶体激活共生网络，最终却被飞船舰队彻底摧毁，星球上的生命意识被强行剥离，融入晶体之中。
冲突的阴影瞬间笼罩下来。外星舰队的到来究竟是善意的接驳，还是毁灭性的回收？联邦总统五十年前的隐瞒背后藏着什么秘密？共生网络激活的“第三阶段”到底意味着什么？这些问题像藤蔓一样缠绕在沈溯的脑海中，而答案，似乎隐藏在更多破碎的意识碎片里。
沈玥蹲在图书馆穹顶下的古树旁，指尖轻轻划过树干上的星图纹路。孩子们的意识与古树共振，发出的音节越来越清晰，她能感受到古树的意识正在与大气层外的飞船对话。突然，古树的枝干剧烈抖动，一段陌生的意识涌入她的脑海：“警告！共生节点出现未知变异，主文明舰队启动清除协议。”
“清除协议是什么意思？”沈玥急忙追问，却发现古树的意识变得混乱。她抬头望去，图书馆的玻璃窗上突然出现了无数细小的裂纹，裂纹的形状与树干上的星图完全一致。而窗外，原本盘旋的信鸽突然集体冲向天空，朝着最近的能量光柱飞去，它们的身体在光柱中瞬间分解，化作无数光点融入光柱之中。
“它们在献祭自己？”一个小女孩吓得躲到沈玥身后，她的意识与一只信鸽残留的意识连接，“信鸽说，这是‘校准能量通道’，只有这样，主文明才能‘安全降落’。”
沈玥的心猛地一紧。她能感受到共生网络中无数生命的意识都在向能量光柱汇聚，无论是植物、动物，还是觉醒的人类，都在被一股无形的力量牵引着，走向未知的命运。她试图用自己的意识阻止，却发现自己的意识在共生网络中如同沧海一粟，根本无法对抗那股来自宇宙的强大力量。
就在这时，她的意识突然捕捉到哥哥沈溯的信号。沈溯让她带着孩子们前往地下洞穴，共生核心或许是唯一能抵抗清除协议的地方。但当她带着孩子们穿过图书馆的地下通道时，却发现通道墙壁上刻满了与古树星图一致的纹路，而通道深处，正传来一阵低沉的轰鸣声，像是某种巨大的机械正在苏醒。
地下三百米，联邦的秘密实验室里，白发苍苍的科学家李维正疯狂地敲击着键盘。屏幕上显示着共生核心的能量波动曲线，还有外星舰队的实时轨迹。五十年前，他是总统身边的助手，亲眼见证了陨石晶体的发掘，如今，他是唯一知道完整真相的人。
“总统骗了所有人。”李维喃喃自语，手指在键盘上飞舞，调出一段尘封的视频。视频中，年轻的总统站在陨石晶体前，与一个模糊的全息影像对话：“主文明承诺，只要激活共生网络，人类就能加入宇宙共生联盟，获得永恒的生命。”而全息影像的回应却被刻意屏蔽，只留下一段冰冷的电子音：“第三阶段，清除变异，意识统一。”
李维当时就意识到了危险，他偷偷修改了实验数据，延缓了共生网络的激活。但他没想到，五十年后，总统会用“意识清除武器”强行激活晶体。更让他心惊的是，他刚刚破解了外星舰队的通讯密码，截获了一段核心指令：“目标星球共生网络出现自主意识，不符合联盟标准，启动行星级清除程序。”
“所谓的共生联盟，根本就是意识殖民。”李维的身体剧烈颤抖，他将这段指令发送给沈溯的同时，实验室的警报突然响起。屏幕上显示，外星舰队已经锁定了实验室的位置，一道能量束正朝着这里射来。他看着屏幕上共生核心的位置，突然明白了沈溯的使命