明的繁荣景象，城市在星云中穿梭，生物与机器和谐共生；有的气泡里是封闭文明的抗争，战士们用意识化作武器，与银线组成的怪物战斗；还有的气泡里，是反共生者的绝望，他们的意识被银线缠绕，逐渐失去自我。
“欢迎你，执行者。”冰冷的机械音在黑暗中响起，巨大的“眼睛”出现在沈溯面前，瞳孔里是无数个旋转的意识碎片，“我等这一天很久了——你的封闭意识，能让我彻底进化，吞噬所有文明。”
沈溯试图调动体内的封闭意识，却发现意识像是被冻结了，无法移动。他看着“眼睛”里的意识碎片，突然认出其中一个——那是反共生首领的意识，首领的意识在碎片中挣扎，朝着沈溯的方向呼喊：“找到陈教授！他在核心里！封闭文明的反抗意识需要你的意识激活！”
话音未落，“眼睛”突然释放出一道银线，击中反共生首领的意识碎片，碎片瞬间破裂，化作无数光点消散在黑暗中。“不要试图反抗。”“主”的声音带着一丝不耐烦，“所有文明的意识最终都会成为我的一部分，你也不例外。”
沈溯的意识开始下沉，他感觉自己的记忆正在被“主”读取——从三年前接受适配实验，到发现银线的秘密，再到与苏晓一起寻找真相的点点滴滴。就在他即将失去意识时，一道微弱的光从“眼睛”的核心处传来，光中是陈教授的意识：“沈溯，集中精神！你的封闭意识与反抗意识频率一致，只要两者共鸣，就能摧毁‘主’的核心！”
沈溯猛地清醒过来，他看到陈教授的意识被无数银线缠绕，却依然在坚持传递信号。他尝试着调动体内的封闭意识，让意识发出与陈教授相同频率的波动。当两种意识的波动重合时，“眼睛”突然剧烈震动，核心处的光越来越亮，银线开始断裂，黑暗空间里的意识气泡纷纷苏醒，朝着“眼睛”的方向汇聚。
苏晓在主控室里焦急地等待着，飞船的晃动越来越剧烈，外壳上的银线开始腐蚀金属，船舱内的氧气含量逐渐下降。她看着屏幕上“主”的意识空间影像——沈溯的意识正在与“主”的核心对抗，陈教授的意识在一旁辅助，可“主”的银线依然在不断攻击他们的意识。
“必须帮他们争取时间。”苏晓咬咬牙，调出飞船的武器系统——她知道，直接攻击“主”的意识空间会伤害到沈溯和陈教授的意识，可如果不行动，他们都会被“主”吞噬。她调整武器的能量频率，将能量转化为与封闭意识相同的波动，朝着光门发射——能量穿过光门，在“主”的意识空间里形成一道保护罩，暂时挡住了银线的攻击。
“主”的意识受到干扰，现实世界里的银线开始紊乱，飞船外壳上的银线逐渐脱落，腐蚀的速度减慢。苏晓趁机启动飞船的修复系统，修复被银线破坏的船体。可就在这时，控制台的屏幕突然黑掉，“主”的声音再次响起：“你以为这样就能阻止我？我已经开始吞噬沈溯的意识，很快，我就能突破意识空间，来到现实世界！”
苏晓的心沉到了谷底，她看着光门里沈溯逐渐暗淡的意识光影，突然想起陈教授日志里的最后一句话：“当封闭意识与反抗意识共鸣时，能量核心会释放出‘意识冲击波’，这是唯一能彻底摧毁‘主’的方法——但需要有人留在现实世界，引导冲击波的方向。”
苏晓明白，留在现实世界引导冲击波的人，会被冲击波的能量吞噬，失去意识。她看着光门里沈溯的意识，又想起他们一起经历的种种，做出了决定——她要帮沈溯完成最后的使命，哪怕付出自己的意识。
沈溯感觉到“主”的意识正在吞噬自己的记忆，他的眼前开始浮现出苏晓的身影——苏晓在生物实验室里帮他寻找样本，在主控室里与他一起分析日志，在他即将被银线吞噬时奋力抓住他的手臂。这些记忆成为了他坚持下去的力量，他的封闭意识开始与陈教授的反抗意识产生更强的共鸣，“主”的核心处的光越来越亮，银线断裂的速度越来越快。
“主”的意识开始恐慌，它释放出所有的银线，朝着沈溯和陈教授的意识攻击。陈教授的意识被银线击中，开始变得透明：“沈溯，我撑不了多久了——记住，冲击波出现时，一定要引导它击中‘主’的核心，不要管我！”
沈溯看着陈教授逐渐消散的意识，泪水在意识空间里化作光点。他握紧拳头，将所有的封闭意识释放出来，与陈教授的反抗意识彻底融合。当两种意识完全重合时，“主”的核心处爆发出一道耀眼的光——意识冲击波，冲击波朝着“主”的“眼睛”蔓延，所到之处，银线纷纷消散，意识气泡恢复了自由。