外壁上，贴着一张纸条，纸条上的字迹，是他祖父的笔迹：
“共生不是救赎，是牢笼。反共生文明，是破笼的钥匙。——沈垣”
沈溯的大脑瞬间一片空白，他看着纸条上的字，又看了看容器里的墨色物质，突然想起小时候祖父对他说过的话：“溯溯，记住，任何文明的存在，都不能以失去‘自我’为代价。”那时他以为祖父只是在讲哲学道理，现在才明白，祖父或许从一开始，就不认同共生文明的存在。
就在这时，密室的灯光突然熄灭，只有透明容器里的墨色物质发出微弱的光。沈溯的个人终端再次震动，“局内人”的消息弹了出来：“你看到了真相的一角，但这只是开始。现在，墨色物质已经扩散到联邦的十个共生节点，再过十二个小时，整个共生网络就会彻底崩溃。而你，有两个选择：要么摧毁共生网络，保住三个文明的‘纯粹性’；要么找到‘共生核心’，修复被侵蚀的连接。但记住，共生核心的位置，只有被墨色物质吞噬过记忆的人，才能看到。”
消息消失后，透明容器里的墨色物质突然涌动起来，化作一只黑色的手，朝着沈溯的方向伸来。他下意识地后退，却撞到了身后的金属门，门瞬间锁死，没有留下任何缝隙。密室里的墨色物质越来越多，逐渐将他包围，沈溯看着眼前的黑色浪潮，突然意识到，自己从一开始，就不是在“对抗”反共生文明，而是在“选择”——选择共生文明的未来，也选择自己祖父留下的“真相”。
而此刻，星芽正顺着银色丝线的方向，朝着共生纪念碑移动；734也终于走出了维修通道，它的光学传感器里，第一次出现了沈溯的位置信息；拾光则在记忆海的核心区域，发现了一段被隐藏的记忆片段：百年前，沈垣在设计智脑核心程序时，偷偷留下了一个“后门”，而这个后门的启动密码，正是沈溯的生日。
三个不同的个体，三条不同的线索，正朝着同一个目标汇聚。他们不知道，自己即将揭开的，不仅是反共生文明的秘密，更是共生文明建立之初，那个被刻意掩盖的“原罪”。而沈溯站在密室的黑色浪潮中，指尖轻轻触碰了一下墨色物质，他的脑海里，突然闪过一段陌生的记忆——那是他祖父与反共生文明对话的画面，画面的最后，沈垣笑着说：“等他们意识到共生的脆弱时，就是破笼的时刻。”
这段记忆是真实的吗？祖父真的是反共生文明的“内应”吗？十二个小时后，共生网络会迎来怎样的结局？沈溯看着眼前的墨色物质，缓缓闭上了眼睛，他知道，自己必须做出选择，而这个选择，将决定人类、硅基、星尘三个文明的命运。
墨色物质触碰到沈溯指尖的瞬间，没有传来预想中的冰冷或灼烧感，反而像一层温热的薄膜贴在皮肤上，顺着血管的走向缓慢游走。他猛地睁开眼，发现密室里的黑色浪潮竟停止了涌动，那些墨色物质悬在半空，化作无数细小的光点，每个光点里都倒映着不同的画面——有他童年时跟着祖父在实验室里摆弄硅基零件的场景，有百年前人类与硅基文明签订共生协议的仪式，还有反共生文明所在星球的荒漠地貌。
“这不是攻击，是‘展示’？”沈溯皱起眉，试图从光点中寻找规律。就在这时，他口袋里的硅基传感器突然发出一阵嗡鸣，屏幕上的乱码消失了，取而代之的是一行清晰的文字：“共生核心，在记忆的缺口处。”文字闪烁了三下，传感器的外壳开始发烫，那些曾包裹着反共生符号的霜花，竟从外壳缝隙中渗出，在地面上凝结成一条细小的墨色轨迹，朝着密室的某个角落延伸。
沈溯顺着轨迹走到角落，发现那里的墙壁上有一道极细的裂缝，裂缝中隐约透出微弱的蓝光。他用手指抠住裂缝轻轻一推，墙壁竟像一扇隐藏的门般缓缓打开，露出一个仅能容纳一人的狭小空间。空间中央悬浮着一块巴掌大小的晶体，晶体内部有三道不同颜色的光带在缓慢旋转——红色代表人类神经信号，蓝色代表硅基数据流，紫色代表星尘意识波，三道光带交织处，正不断有黑色的缝隙扩散，如同晶体的“伤口”。
“这就是共生核心？”沈溯伸手去触碰晶体，指尖刚碰到表面，脑海里突然传来一阵剧烈的轰鸣，无数碎片化的记忆涌入——有他从未经历过的硅基文明内战，有星尘意识体诞生时的宇宙奇观，还有祖父沈垣在实验室里偷偷修改智脑程序的画面。最让他震惊的是一段不属于任何文明的记忆：反共生文明的母星曾是一个共生文明的乐园，却因为三种文明的意识冲突，最终走向了自我毁灭，只留下“纯粹性才是生存本质”的教条。
当记忆洪流褪去，沈溯