局势危急之时，郑一民发现雇佣兵的后方出现了混乱。原来是一群神秘的黑衣人加入了战斗，他们身手敏捷，专门攻击雇佣兵的薄弱环节。在黑衣人的帮助下，重案六组逐渐扭转了战局。经过一番激烈的厮杀，雇佣兵们纷纷倒下。郑一民走向黑衣人，正要询问他们的身份，为首的黑衣人却摘下了面罩，竟是失踪多年的科学家之一。他告诉郑一民，他们一直在暗中调查神秘势力，希望能和重案六组联手，彻底揭开背后的阴谋。郑一民欣然答应，一场新的挑战即将来临。
科学家带来了关键情报，原来神秘势力正在利用遗迹中的古老力量，妄图开启时空裂缝，释放出未知的恐怖存在。时间紧迫，重案六组和科学家们迅速制定作战计划。他们再次深入遗迹，这一次有了科学家的指引，避开了不少危险机关。可越接近核心区域，防御越严密。他们遭遇了能量护盾的阻拦，常规武器根本无法突破。科学家们赶紧研究破解之法，而郑一民则带领组员吸引敌人火力。就在护盾即将被攻破时，神秘势力启动了终极防御，一群机械巨兽从地下涌出。重案六组和科学家们背水一战，在激烈的战斗中，他们不断寻找巨兽的弱点。终于，在大家的共同努力下，成功击败巨兽，突破护盾。此时，时空裂缝已经开始微微颤动，一场与时间和邪恶的赛跑进入了最关键的阶段。
郑一民深知，若时空裂缝完全开启，后果不堪设想。他和众人不顾一切地冲向裂缝控制装置。就在他们即将靠近时，神秘势力头目突然出现，他手中拿着一个神秘水晶，疯狂地念着咒语，试图加速裂缝的开启。郑一民怒目圆睁，冲上去与头目展开搏斗。与此同时，科学家们争分夺秒地寻找关闭裂缝的方法。战斗异常激烈，郑一民渐渐有些力不从心。而此时，裂缝越来越大，一股强大的吸力将众人往里面扯。就在这千钧一发之际，科学家们成功找到了关闭装置的关键，按下按钮。裂缝开始缓缓闭合，神秘头目见状，绝望地嘶吼着。随着裂缝的消失，神秘头目也瘫倒在地。重案六组和科学家们相视一笑，他们再次成功阻止了一场灾难。但他们知道，神秘势力或许还有余孽，未来仍有更多挑战等待着他们。
回到警局后，众人还没来得及好好庆祝，就发现神秘头目身上的神秘水晶竟不翼而飞。郑一民意识到，这神秘势力或许真还有余孽在暗中蛰伏。果不其然，没过几天，城市中陆续出现一些奇怪的现象，动物开始发狂伤人，人们也时常感到莫名的恐惧。郑一民带领重案六组和科学家们再次展开调查，发现这些现象都与神秘水晶有关。他们追踪线索，来到了城市边缘的一座废弃工厂。刚进入工厂，就触发了一系列机关陷阱。众人小心应对，可还是在一个巨大的机械迷宫中迷失了方向。就在这时，神秘势力的残余成员出现，他们操控着改造后的机械傀儡发起攻击。重案六组和科学家们沉着应战，在一番激烈战斗后，终于突破重围，找到了神秘水晶。然而，水晶被一股神秘力量保护着，想要取出并非易事。他们能否成功取出水晶，彻底消除神秘势力的威胁，又将面临怎样的新挑战，一切都充满了未知。
郑一民仔细观察水晶，发现周围有一些闪烁的符文，似乎是开启保护力量的关键。科学家们迅速开始分析符文，试图找出破解之法。与此同时，神秘势力的残余成员不断派出更多机械傀儡，战斗愈发激烈。组员们奋力抵挡，为科学家争取时间。就在大家都紧张万分时，一名科学家突然喊道：“我找到了破解方法！”众人精神一振。按照方法，他们成功解除了水晶的保护力量。然而，就在郑一民伸手去拿水晶时，水晶突然发出一道强光，一个虚幻的身影从中浮现。这竟是神秘势力头目残留的意识，他疯狂地说：“你们以为拿走水晶就结束了吗？这只是开始！”说完，身影消散，水晶也开始剧烈震动。郑一民当机立断，带着水晶迅速撤离工厂。他们明白，这新的变故意味着神秘势力的威胁远未消除，一场更艰难的战斗还在等着他们。