对于李成梁的奏疏，朱载坖是详细看了几遍，仍旧下不定决心，一方面是乌鲁木齐的重要性，作为瓦剌在西域重要的住牧地，乌鲁木齐地区的重要是可想而知的，官军要是能够夺取乌鲁木齐的话，能够极大的削弱瓦剌部在西域的力量，但是作为瓦剌部重要的住牧地，蒙古人是对于此地很看重的，再加上官军已经收复了庭州，可以说兵锋直指乌鲁木齐，蒙古人不可能不防范官军，这点是肯定的，这就意味着官军丧失了奇袭的条件和可能。
但是就此罢手，等待时间，也不是一个好的选择，一方面是朱载坖自己不甘心，另一方面就是庭州始终受到蒙古人的威胁，这点对于朱载坖来说如芒在背，极为痛苦，所以朱载坖有些纠结，而且现在住牧在乌鲁木齐的是瓦剌部中卫拉特联盟中的和硕特部，实力是很强大的。
之前朱载坖通过土默特部已经了解了瓦剌各部的情况，和硕特部是卫拉特蒙古四部之一，早期活跃于贝加尔湖西南至额尔古纳河下游的森林草原地带。其首领家族为成吉思汗之弟哈布图哈萨尔后裔，在卫拉特联盟中长期居于盟主地位。在卫拉特四部中，和硕特部和成吉思汗的黄金血脉关系是最亲密的，由于和硕特部为成吉思汗的直系血统，在四部中地位最高。自从它的创建人博贝买尔孜到鄂齐尔图汗，前后经四代约100多年，噶拉噶斯氏贵族和硕特首领一直担任“丘尔干”的“达尔加”（即盟主），统处四大部落事务。
现在和硕特部的首领是图鲁拜琥，他的父亲哈尼诺颜洪果尔之前在蒙古人的内斗中被杀，而追考和硕特部的源流，其实和其余三部是不同的，和硕特部和瓦剌的关系并不亲密，反而是和土默特部等部的关系比较亲密，和硕特首领家族则起源于福余卫首领系成吉思汗弟弟哈撒儿后裔。当时福余卫汗位传至阿克萨噶勒泰，其长子为阿噜克特穆尔，次子乌噜克特穆尔，两人因分遗产不均，分得老弱属民的乌噜克特穆尔便率领本部归附脱欢。脱欢亲赐和硕特之名，并将女儿嫁给他，收其为女婿。
而脱欢也是朱祁镇的瓦剌班主任也先的父亲，也就是朱祁镇的师爷，在也先被脱脱不花所杀之后，和硕特部选择跟随瓦剌西迁，和硕特加入卫拉特，是卫拉特史上的一件大事，其影响是十分深远的。和硕特贵族取代绰罗斯氏的统治地位，始称“卫拉特汗”，和硕特部已势冠四卫拉特部。
从图鲁拜琥的爷爷开始，和硕特部就成为了卫拉特的领导者，他的爷爷博贝密尔咱系成吉思汗弟哈布图哈萨尔第十六代孙，属博尔济吉特氏，嘉靖二十年，博贝密尔咱被推举为卫拉特联盟盟主，成为首位使用“卫拉特汗”称号的首领。他通过“丘尔干”会盟制度协调各部关系，强化联盟的军事与政治统一。在其统治期间，卫拉特联盟势力范围扩展至额敏河至乌鲁木齐地区。和硕特部也就长期住牧于此。
作为现在在西域实力最强的蒙古部落，和硕特部的势力不容小觑，当年全盛时期的俺答汗也曾经西征，作为蒙古的一代雄主，俺答的军事能力是毋庸置疑的，而俺答汗在蒙古诸部中最强劲的两个敌人就是察哈尔部和卫拉特，察哈尔部主要因为占据了蒙古正朔，但是俺答还是能够逼得打来孙东迁，而卫拉特则是使得俺答铩羽而归的。随着东蒙古与喀尔喀的先后崛起，卫拉特重新陷入到了与东蒙古的无尽战争当中。嘉靖初期，东蒙古的俺答汗势力崛起。在俺答汗的主持下，东蒙古诸部对卫拉特发起了新一轮的攻势。
嘉靖三十七年，俺答汗出兵，“越库凯罕山袭击厄鲁特、巴阿图特”。尽管一些土默特部称俺答汗在此次征伐后“囊括四瓦剌，收归自己控制之下”，但实际效果可能并不如此完满，至少俺答汗并未将卫拉特纳入麾下。然后在嘉靖四十一年和隆庆二年，俺答再次征讨瓦剌，据土默特部自称，在此战中，卫拉特部主动投降，其首领“率其诸子属众归附君可汗”。
但是实际上可能并不是这样的，俺答实力强劲，也确实是蒙古人中的一代雄主，但是他征讨瓦剌并没有多顺利，卫拉特可能并未屈服于俺答汗的权威，因为此后卫拉特与东蒙古之间的战争仍在继续，卫拉特也并非一直处于被动挨打的地位。隆庆八年，切尽·黄台吉与布延巴图尔鸿台吉共同出兵攻打卫拉特。但在此战中，布延巴图尔鸿台吉先胜后败，被卫拉特辉特部的王公额色勒贝率军杀死。
虽然俺答实力强劲，但是并没有对卫拉特真的实施统治，不过卫拉特也面临着除了土默特部之外的威胁，就是喀尔喀蒙古的威胁，所谓喀尔喀