发明了计算金星、水星凌日的方法，并提出了精确计算日月食的方法——这在华夏是史无前例的。
1680年某夜，一位法国传教士带着最新的《天文年历》来访时，王锡阐在油灯下展示了惊世骇俗的魔术——用六枚铜钱摆出当年所有月食时刻，与巴黎皇家科学院数据完全吻合。这个被记载在《耶稣会士书简集》中的场景，让欧洲学者第一次意识到：远东有位布衣天文学家，竟用东方算具解开了西方微分方程才能计算的难题。
《晓庵新法》是他最具代表性的作品，成为后世研究天文历法的重要参考。同时代人对他的评价极高，他与北方的历算名家薛凤祚并称为“南王北薛”。顾炎武也对其天文学造诣深表敬意，称其为“学究天人”。
王锡阐潘耒的哥哥潘柽章是至交好友，潘耒曾受业于王锡阐数年，相当于王锡阐的弟子。王锡阐一生无子女，临终时将《晓庵新法》手稿交给了潘耒。王锡阐去世后，潘耒整理并刻印王锡阐的遗稿。
郭松军在扬州找到潘耒的后人时，发现虽然时空线已改，但王锡阐依然病死于1682年。但因为在整理老师的手稿中，潘耒惊叹于老师的大才，发誓要将王锡阐的研究传承下去，所以广开大门收弟子，并以王氏弟子自称。，所有投入门下的弟子都以研习王锡阐的着作为主。
在这一过程中，不少弟子门人对王锡阐提到的自然宇宙与人类命运之间的奥秘发生了重大兴趣，进而开始学习道家之术，试图将二者结合起来以探究大道之秘，这些人中就有潘行！